Carsten Wilke naît en 1962 et suit des études à Cologne, à Paris et à Jérusalem. Après un doctorat d’études juives, romanes et de philosophie à l’Université de Cologne, il est diplômé de l’Ecole Pratique des Hautes Etudes en sciences religieuses en 1994. Depuis 2006, il est chercheur à l’Institut Steinheim d’histoire juive allemande à Duisburg, en Allemagne. Il enseigne également dans diverses universités : l’École supérieure des études juives de Heidelberg (2005-2006), l’Université de Düsseldorf (2006-2007), l’Université libre de Bruxelles (2008), l’Université de Tokyo (2016).

Grand spécialiste de l’histoire des Juifs et du judaïsme, il enseigne depuis 2009 à la Central European University. Il rédige également un grand d’ouvrages et articles sur les relations entre le christianisme et le judaïsme, la civilisation judaïque médiévale et la modernisation de la religion au XIXe et XXe siècles. Son ouvrage, Histoire des juifs portugais, est une référence dans le domaine.