Né dans le diocèse de Clermont en 1650 d’une vieille famille de la noblesse bourbonnaise, Jean de la Mousse est admis au noviciat de Paris à l’âge de 17 ans. De 1669 à 1671, il fait des études de philosophie, avant de passer six ans au collège de Nevers. Il enseigne les humanités jusqu’en 1679, puis se tourne vers des études de théologie.

Ordonné prêtre en 1682, il part en mission pour la Guyane, où les Français sont installés depuis 1664. Là, pendant quinze ans, Jean de la Mousse parcourt les villages indiens, loin de l’île de Cayenne, dans l’espoir d’évangéliser les « Sauvages ». Rempli d’humilité et d’humanité, le témoignage de son relatif échec missionnaire n’a pas la tonalité supérieure des Lettres édifiantes et curieuses des missionnaires jésuites guyanais au XVIIIe siècle.

En 1698, des soucis de santé l’obligent à revenir en France. Il meurt peu après au collège jésuite de Moulins.