Spécialisée en histoire du Sud-Est africain aux XVIe et XVIIe siècles, et en particulier à celle ayant trait au Mozambique, au Zimbabwe, et au Malawi, Florence Pabiou-Duchamp soutient une thèse sur João dos Santos, un dominicain portugais dans le Sud-Est africain (1586-1622) : une histoire de l’Éthiopie Orientale en 2007. Enseignant-chercheur en histoire de l’Université Paris 1 Panthéon-Sorbonne, affiliée à l’IMAF-Malher, elle mène des recherches sur les médiations culturelles et les rapports entre l’Afrique du sud-est et le Portugal.