Né à Rio de Janeiro, Paulo Henriques étudie la peinture à l’Ecole Supérieure des Beaux-Arts et l’histoire de l’art à l’Université Nouvelle de Lisbonne. Entre 1992 et 1998, il dirige le musée José Malhoa, puis le Museu Nacional do Azulejo en 1999. Commissaire de nombreuses expositions, il publie un grand nombre d’ouvrages sur la céramique portugaise aux XIXe et XXe siècles. Depuis 2007, il est le directeur du Museu Nacional de Arte Antiga (MNAA).